Стивен Джон Эмери родился 11 октября 1969 года в Брэнтвуде, Эссекс, Англия. Он посещал Ingrave Johnstone Primary School – ответвление от St. Martin’s School, общеобразовательной школы в Хаттоне, графство Эссекс. Родители Стивена развелись, но оба повторно завели семью и продолжают жить в Эссексе, где его мать связана с театром Брентвуд (Brentwood), которому Стивен начал покровительствовать в 2007 году. У него есть так же сестра Аманда.
Воспитанный в деревнях Ингрейв (Ingrave) и Херонгейт (Herongate), Стивен с ранних лет занимается спортом – играет в футбол, теннис, крикет, играет в настольный теннис за школу и другие местные команды, регби; поет в местном церковном хоре (зарабатывал таким образом деньги на карманные расходы, для того, чтобы петь на свадьбах и играть в Top Trumps), принимал участие в школьных постановках и в драматических кружках.
В 13 лет его выбрали играть Тома Сойера в одной из первых постановок школы и именно с того момента он понял, что актерство это то, чем бы он хотел заниматься. В то же время Стивен начал выступать с некоторыми любительскими коллективами в Брентвуде, Челмсфорде и Колчестере (Chelmsford & Colchester), в Эссексе, где он продолжал делать свое имя, играя в музыкальном театре.
Стивен окончил Лондонскую Академию музыки и драматического искусства (LAMDA). После её окончания Стивен работает в театре в течение пяти лет. Он работал с Национальным театром в Уэльсе (National Theatre of Wales), Королевской Шекспировской Компанией (Royal Shakespeare Company) и Oxford Stage Company, работа, которая включала в себя поездки в тур по Японии и Великобритании и роль Ромео в постановке «Ромео и Джульетта». Затем Стивен поменял театр на телевидение и кино, объясняя такой переход тем, что он не видел больше в театральной деятельности роста своей карьеры.
Стивен принял участие во многих телевизионных постановках, наиболее он мог запомниться широкой публике после исполнения роли принца Вэлианта в одноименном фильме 1997 года, но после этого он вновь сконцентрировал свою деятельность на сериалах и фильмах в основном британского производства, но играл в таких фильмах как «Перо Маркиза де Сада», «Воздержание», «88 минут» и других. В 2008 году Стивен начинает играть Билла Комптона, одного из центральных персонажей, в сериале True Blood. Именно эта роль снова заставила вспомнить о нем актерские круги и принесла ему огромную популярность и признание публики.
У Стивена есть сын Билли, который родился в 2000 году и дочь Лилак, рожденная в 2002 от предыдущих отношений. В настоящее время Стивен и его невеста Анна Пакуин готовятся к свадьбе, они объявили о своей помолвке 9 августа 2009 года.